都道府県別感染者数とポアソン回帰分析 ― 2021年02月05日 03:59
都道府県別新型コロナ感染者数のポアソン回帰分析を何度か実施した。(2020年12月11日など)
この統計分析モデルで使われるポアソン分布とは、2項分布(感染する確率と感染しない確率の2項)をn人に適用したモデルにおいて、感染する確率を非常に小さく、nを非常に大きくした場合の極限分布として得られるもので、希少事象に適用できるので疫学研究によく使われている。
では、都道府県別新型コロナ感染者数の場合、実際にはどう考えればいいのか。
ポアソン分布で前提としているのは、感染率が都道府県に拠らず一定ということである。
この場合、仮に47都道府県の人口がすべて同じであれば、感染者数も同一というのが決定論であり、統計論では、神のみぞ知る、或いは未知の条件の影響により、感染者数は人口が同じでも都道府県ごとに異なるが、その分布がポアソン分布に従い、その平均値が人口×感染率になる。
実際には、都道府県ごとに人口が異なるので、ポアソン回帰分析では感染者数を人口で割った値を対象に分析し、人口はオフセット項と呼ばれ、感染率に対する回帰解析結果を感染者数に戻すときに用いられる。
ところで、都道府県が1つだけだったらどうなるのか。
この場合には、データは一件だけである。その感染者数は人口に対しある値であり、それが単に観測された感染率だというだけで、分布というものはないことになる。しかし、それでも日ごとに感染者数は異なるはずで、それがポアソン分布すると考えることができる。
その場合、統計的な平均感染率λは、人口×日(複数の観測期間)という値(暴露量と呼ぶらしい)に対し、λ/日として定義しなおし、複数の期間ごと(複数の異なる一日でもよいが)の感染者数を対象に回帰分析を行えば得られることになる。
この統計分析モデルで使われるポアソン分布とは、2項分布(感染する確率と感染しない確率の2項)をn人に適用したモデルにおいて、感染する確率を非常に小さく、nを非常に大きくした場合の極限分布として得られるもので、希少事象に適用できるので疫学研究によく使われている。
では、都道府県別新型コロナ感染者数の場合、実際にはどう考えればいいのか。
ポアソン分布で前提としているのは、感染率が都道府県に拠らず一定ということである。
この場合、仮に47都道府県の人口がすべて同じであれば、感染者数も同一というのが決定論であり、統計論では、神のみぞ知る、或いは未知の条件の影響により、感染者数は人口が同じでも都道府県ごとに異なるが、その分布がポアソン分布に従い、その平均値が人口×感染率になる。
実際には、都道府県ごとに人口が異なるので、ポアソン回帰分析では感染者数を人口で割った値を対象に分析し、人口はオフセット項と呼ばれ、感染率に対する回帰解析結果を感染者数に戻すときに用いられる。
ところで、都道府県が1つだけだったらどうなるのか。
この場合には、データは一件だけである。その感染者数は人口に対しある値であり、それが単に観測された感染率だというだけで、分布というものはないことになる。しかし、それでも日ごとに感染者数は異なるはずで、それがポアソン分布すると考えることができる。
その場合、統計的な平均感染率λは、人口×日(複数の観測期間)という値(暴露量と呼ぶらしい)に対し、λ/日として定義しなおし、複数の期間ごと(複数の異なる一日でもよいが)の感染者数を対象に回帰分析を行えば得られることになる。
コロナウイルスの今後 ― 2021年02月05日 11:32
インフルエンザウイルスは元々シベリアのツンドラ凍土に冷凍保存されているが、渡り鳥が啄んで中国に運びニワトリ、豚、ヒトと変異しながら伝染する。
ツンドラ凍土には様々な遺伝子型のインフルエンザウイルスが保存されているので、地球温暖化により新たなウイルスが広がる可能性がある。
新型コロナはコウモリから拡散したらしいが、コウモリは飛ぶための心臓は駆動回数が多く、体温も高いために様々なウイルスに無症状感染することができる。
これらから2つの可能性が考えられる。
(1)冷凍食品が新型コロナ汚染され、全国に拡散する可能性。
(冷凍食品を大量廃棄した中国のニュースが思い出される。)
(2)高体温動物が感染し、ヒトに変異型をうつす可能性。
(体温の高いこともが無症状、感染しにくいということが思い出される。)
いづれもワクチンの効果がはっきりするまでは注意しなければならない。インフルエンザのように変異型別のワクチンが必要になる可能性もある。
ツンドラ凍土には様々な遺伝子型のインフルエンザウイルスが保存されているので、地球温暖化により新たなウイルスが広がる可能性がある。
新型コロナはコウモリから拡散したらしいが、コウモリは飛ぶための心臓は駆動回数が多く、体温も高いために様々なウイルスに無症状感染することができる。
これらから2つの可能性が考えられる。
(1)冷凍食品が新型コロナ汚染され、全国に拡散する可能性。
(冷凍食品を大量廃棄した中国のニュースが思い出される。)
(2)高体温動物が感染し、ヒトに変異型をうつす可能性。
(体温の高いこともが無症状、感染しにくいということが思い出される。)
いづれもワクチンの効果がはっきりするまでは注意しなければならない。インフルエンザのように変異型別のワクチンが必要になる可能性もある。
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